Εξειδικευμένες μετρήσεις θα πραγματοποιούνται κάθε μήνα στον Θερμαϊκό Κόλπο από την ομάδα του Ελληνικού Κέντρου Βιοτόπων-Υγροτόπων, ώστε να παρακολουθείται η ποιότητα της θάλασσας στον όρμο της Θεσσαλονίκης. Σύμφωνα με τις έως τώρα μετρήσεις, τα νερά της θάλασσας στον όρμο της Θεσσαλονίκης κατατάσσονται σε υψηλή μεσότροφη έως και εύτροφη κατάσταση. Ωστόσο, ένα από τα προβλήματα που παρατηρούνται τα τελευταία χρόνια, είναι τα επιπλέοντα απορρίμματα στην επιφάνεια του Θερμαϊκού, και εικόνες με σκουπίδια να καταγράφονται αρκετά συχνά στο παραλιακό μέτωπο.