Τα υλικά που περιέχουν τα self test θεωρούνται βιολογικά επικίνδυνα απόβλητα και γι’ αυτόν τον λόγο πρέπει να είμαστε ιδιαίτερα προσεκτικοί κατά την διαδικασία της απόρριψης τους μετά την χρήση. Ειδικές οδηγίες για την απόρριψη και ορθή διαχείριση των αποβλήτων από τη χρήση των self-test είχε εκδώσει η Γενική Γραμματεία Συντονισμού Διαχείρισης Αποβλήτων του υπουργείου Περιβάλλοντος και Ενέργειας.